使用TCGA简易工具下载breast的solid tissue normal的CNV数据，里面分为grch38.seg.txt和nocnv_grch38.seg.txt，想问一下这两个格式的文件有什么区别？我想做一个不患乳腺癌的reference，需要用到什么文件呢？ - 生信人

使用TCGA简易工具下载breast的solid tissue normal的CNV数据，里面分为grch38.seg.txt和nocnv_grch38.seg.txt，想问一下这两个格式的文件有什么区别？我想做一个不患乳腺癌的reference，需要用到什么文件呢？

使用TCGA简易工具下载breast的solid tissue normal的CNV数据，里面分为grch38.seg.txt和nocnv_grch38.seg.txt，想问一下这两个格式的文件有什么区别？我想做一个不患乳腺癌的reference，需要用到什么文件呢?

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1 个回答

生信菜鸟团 - 博士在读 2017-09-26 17:59

只有带上了nocnv标签的文件里面存储着的才是真正的somatic CNV。因为CNV大部分是用芯片测得的，至于你说的不患乳腺癌的reference，我没有get到你的点

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姝婧怡提出于 2017-09-22 22:52