TCGA的很少会是单细胞数据吧,最简单的办法就是跟你做的癌种Pubmed找同癌种文章,看下别人是怎么介绍TCGA数据的
大家好,我下载了TCGA的FPKM和count数据,做了一些分析再加上其他的写了一篇文章在投稿,但是审稿人问我:你使用的数据,是单细胞RNA-seq数据吗?对细胞进行了多少次读取? 数据的质量如何? 比较转录组分析使用哪种算法? 数据是从几个不同的研究实验室获得的吗? RNA-seq数据的数字基因表达中的统计共同因素是什么? 对于从不同来源获得的数据,采用了什么收集方法以及采取了哪些措施来防止批次效应和规范化程序?
这好像是属于TCGA的测序信息了吧?请问在哪里可以查到?或者大家知道吗?