5 基因count数与转录本count数差别极大吗?

公司返回测序数据,对比发现在基因表达文件中count数有几千乃至上万,然而在mRNA表达文件中这个基因的转录本count数几乎没有。以下是一具体例子:

attachments-2019-11-YKp0OvoH5dd89b205d549.png这样是正常的吗,我查了下A2M这个基因在ensembl中的长度为chr12:9067664-9116229,最长的一个能够编码蛋白的转录本是9067712-9116157,基本都对上了。

这样差异基因是用基因表达文件还是用mRNA表达文件?

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1 个回答

调研图

这个不太了解,个人觉得一个基因可能对应多个转录本导致的

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  • xdh 提出于 2019-11-23 10:39

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