公司返回测序数据，对比发现在基因表达文件中count数有几千乃至上万，然而在mRNA表达文件中这个基因的转录本count数几乎没有。以下是一具体例子：
这样是正常的吗，我查了下A2M这个基因在ensembl中的长度为chr12:9067664-9116229,最长的一个能够编码蛋白的转录本是9067712-9116157，基本都对上了。
这样差异基因是用基因表达文件还是用mRNA表达文件？
这个不太了解，个人觉得一个基因可能对应多个转录本导致的
这样是正常的吗，我查了下A2M这个基因在ensembl中的长度为chr12:9067664-9116229,最长的一个能够编码蛋白的转录本是9067712-9116157，基本都对上了。