我用edgeR包分析TCGA里的counts数据，分析出来一个基因logFC=3点多，p值也很小，但是当我把这个基因单独拎出来，exp取log2+1，用500多个癌症样本和40多个癌旁样本比较做出来的小提琴图显示两组p值没有差异，请问有这种可能吗，还是分析出错了
一般来说不会的吧，在edgr处理TCGA数据的时候，中间会有一步得到校正后的表达矩阵，你把这个矩阵输出出来，用这个表达矩阵里的基因表达量试试看
