wanli ma
wanli ma - 在读研究生

性别: 山东 - 青岛 注册于 2020-07-03

一个想学生新还不停掉头发的毒理。。。

向TA求助
2金币数
110 经验值
0个粉丝
主页被访问 1159 次,0,

最近动态

2020-10-07 21:50 发起提问

2020-09-10 22:23 回答问题

代码难弄的时候,有个笨办法。就是把探针列和gene symble列提取出来,在excel里用vlookup命令查找出哪些探针在我们的数据里,然后进行排序,就可以完成匹配了。还有就是有一些注释文件没有固定的gene symble列,但是可以看出来在哪一列,是不是用 / 来分割的。是的话也可以用excel根据/进行分裂,从而提取到gene symble信息

2020-09-10 22:18 回答问题

对重复数据进行合并取均值。一般我是这么来做的

2020-09-10 22:18 回答问题

一般来说都是以2为底的

2020-09-10 22:16 回答问题

一般来说不会的吧,在edgr处理TCGA数据的时候,中间会有一步得到校正后的表达矩阵,你把这个矩阵输出出来,用这个表达矩阵里的基因表达量试试看

2020-09-10 22:12 回答问题

您好,GEO数据库和TCGA数据联合分析大多是分别用这两个数据库来做同样的分析,用于去交集或者相互验证。样本信息来说,这两个数据库的样本来源是不同的,可能没办法进行样本的整合。

2020-09-10 22:09 发起提问

2020-07-24 12:02 对问题追加悬赏

2020-07-04 12:44 发起提问