TCGA 成熟体miRNA数据（isoform）为什么同一肿瘤内的不同样本的miRNA数目不一样

TCGA同一肿瘤的不同样本（癌旁/患者）测得的miRNA数目不一样（比如KICH肿瘤中有1770个miRNA，癌旁样本中有1610个），而且它们的并集miRNA数量也小于miRBase中的成熟体miRNA数量，想问一下，那些没测得的miRNA是因为表达量为0还是说没有设计对应的探针测？

谢谢帮忙解答的老师~

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师 2020-07-30 09:51

这个是正常的，因为小RNA并不是每次都能鉴定到的