批量生存分析软件运行后数据缺失问题

将TCGA上下载的基因数据整理后得到A基因的P值<0.05,logFC大于2,通过查阅文献发现A基因与肿瘤的生存预后相关。但将原始数据导入批量生存分析软件,运行后得出的基因生存数据中却不含A基因,请问这是什么原因,请求大神指点!感谢!

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

TCGA数据做cox最好做一下标准化(用这个:http://gap.shengxin.ren/tool/6/),因为数值区间太大,很多基因无法计算出cox,就被过滤了

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