GSEA结果解读遇到问题,求解答,谢谢!

attachments-2017-10-PaqGsH2p59e705d6bf8e1.png1、请问ES值必须是0吗,我的有些>0,有些<0?

2、我分了H(5个样本)和L(8个样本)两个组。图上的竖线代表进入这个基因组合的所有基因共18个,从左到右表达量降低。请问,红色和蓝色区域是代表上调和下调吗?

3、像我这个图应该如何理解?

谢谢!


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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

结果解读看这里 https://www.shengxin.ren/question/317

不是上下调,是你分组的H和L样本中表达水平的排秩,ES小于0 在L中富集,大于0在H中富集

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