还是要提前数据筛选,清洗干净再用R分析。
win10,office16,64位,RNA-seq,下载了最新的decenter软件
https://pan.baidu.com/s/1kVGHmaN,这是我要分析的文件
以下是报错的代码
读取C:/GSE37406/GSE37406_family.xml/Merge_GPL14903.expro.txt中,请稍候...
读取完毕。
读取C:/GSE37406/GSE37406_family.xml/SampleInfo.xls中,请稍候...
读取完毕。
输出路径已经设置为:C:/GSE37406/GSE37406_family.xml/output
参数设置完毕:
表达矩阵文件:C:/GSE37406/GSE37406_family.xml/output\tmp-Merge_GPL14903.expro.txt
样本信息文件:C:/GSE37406/GSE37406_family.xml/output\tmp-SampleInfo.xls
输出路径:C:/GSE37406/GSE37406_family.xml/output
所使用的方法:edgeR(counts数据)
p值:0.05
fold change值:1.0
样本类型列为:第2列
正在运行,请稍后...
是否正确运行:否
输出信息:无
错误信息:b'Error in (1 - h) * qs[i] : \xb6\xfe\xbd\xf8\xc1\xd0\xd4\xcb\xcb\xe3\xb7\xfb\xd6\xd0\xd3\xd0\xb7\xc7\xca\xfd\xd6\xb5\xb2\xce\xca\xfd\r\nCalls: quantile -> quantile.default\r\n\xcd\xa3\xd6\xb9\xd6\xb4\xd0\xd0\r\n'
运行出错,请检查你的数据!
请老师解答!谢谢