有参转录组软件求助

您好，

我是一只努力向上的生信小白。

想问问您关于有参转录组分析软件的，我从NCBI上下载了sra数据，也专程fastq格式了，也搞定了转录本，但是，重点来了，我下载的是单端测序文件（只有一个fastq文件），所以，问题来了，我通过查看fastq文件，知道每个片段的长度为36bp，但是标准偏差是什么？有点不知所以。。。

有点啰嗦，请老师指点

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2 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师 2017-10-27 09:35

36bp的数据这也太短了吧，单末端的数据需要你提供片段长度和标准偏差的，如果你不确定可以设长度的10%左右

刘永鑫 - 工程师 2017-10-28 09:56

这么旧的数据别用了，和现在的数据比起来，系统差异还是非常大的。