使用DEcenter前是否要将芯片表达矩阵进行预处理?

祝老师,我用芯片的数据,用DEcenter时老有这个警告跳出来,“数据表中有重复的基因XX,是否移除它并继续运行”感觉重复的基因太多了,是不是我们提取出来的表达矩阵还需要预处理,才能进行差异分析的呀?

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

你提取出来的表达矩阵应该是没有合并多个探针对于一个基因的情况,才存在上述问题,如果是GEO下载的数据建议使用GEO数据转换器。

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  • Tanya 提出于 2017-11-13 11:59

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