GSEA简易小工具无法生成my analysis GSEA结果文件夹

我首先按照GSEA小工具教程(包括芯片转换方法亦同教程)上传数据GSE18462,同样以ERBB2为目的基因进行富集。点击“批量运行”并保存(无论所在文件夹是否以中/英文命名)后,均弹出“GSEA运行出错”(如图),点击“确定”后继续弹出”运行成功“(如图),然而文件夹里只有gmt和cls文件,无analysis GSEA.

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4 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

你检查一下gmt和cls文件是否是正常的,我猜测是GSEA在你的电脑上运行不正确,你的目录里有空格之类的吗

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freescience猴哥 - 医生

我也遇到这样的问题,后来我 也在自己服务器上试了一下,传统的gsea,主要是 gct这个文件格式不对,请帮忙看看啊

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山师 - 学生

你好,我也遇到同样的问题,请问你解决了吗?


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陈艳

请问要怎么检查gmt和cls文件是否是正常的??

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