DECenter转换数据,报错:是否正确运行:否 输出信息:b'ERROR : contrasts can be applied only to factors with 2 or more levels \r\n' 错误信息:无 运行出错,请检查你的数据!

如题,请问是哪的问题?表达矩阵和样本信息都读取正确,具体代码如下:读取C:/Users/Administrator/Desktop/GSE2379/GSE2379_family.xml/Merge_GPL8300.expro.txt中,请稍候...

读取完毕。

读取C:/Users/Administrator/Desktop/GSE2379/GSE2379_family.xml/SampleInfo.xls中,请稍候...

读取完毕。

输出路径已经设置为:C:/Users/Administrator/Desktop/GSE2379/GSE2379_family.xml

参数设置完毕:

表达矩阵文件:C:/Users/Administrator/Desktop/GSE2379/GSE2379_family.xml\tmp-Merge_GPL8300.expro.txt

样本信息文件:C:/Users/Administrator/Desktop/GSE2379/GSE2379_family.xml\tmp-SampleInfo.xls

输出路径:C:/Users/Administrator/Desktop/GSE2379/GSE2379_family.xml

所使用的方法:limma(芯片)

p值:0.05

fold change值:1.0

样本类型列为:第2列

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

你的这个版本存在一些问题,保存目录不要和你的数据目录一致,建议使用最新版

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  • tnt 提出于 2017-11-27 15:57

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