TCGA miRNA数据下载后数据与其他途径下载不匹配

您好,祝老师!

按照您的建议,我今天尝试了用你们的下载工具下载了miRNA数据,下载后利用软件自带合并功能,产生了一个合并TXT文件,用Excel打开后,发现有错位现象,并且产生了一列无用的YN信息,最后两列数据没有抬头(如图所示)。我通过调整错位并删除了无用的那一列后,发现上面的数据和我之前从firebrowser上下载的数据不一致。我的问题是:1.我下载的是BSGSC miRNA profiling对不对,和BSGSC miRNA profiling isoform有什么区别?2.你们工具下载的是不是miRNA的reads per million数据?3.是不是合并过程中出现了错误,从而导致错位,不知我调整的对不对?谢谢!

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

你这个是合并的问题,你是不是自己修改了fileID.tmp文件,你标出来的那一列对应的样本再合并时读取的数据列与其他的不同。你再检查一下

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  • 无品墨客 提出于 2017-11-29 06:53

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