GEO和TCGA表达水平的单位

老师您好,请问TCGA上基因的表达使用的是FPKM。怎么样转换GEO芯片的表达单位,使两者可以同时比较?谢谢老师

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2 个回答

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两者是独立的,不建议整合。但可作为两个不同的独立人群/数据来描述。如能一致,对你的结论支持更大。

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祝让飞 - 生物信息工程师

这个目前没有什么好的办法,量纲不同是不能比较的

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