3 用简易TCGA下载工具下载的miRNA-Seq-BCGSC miRNA Profiling数据,其中reads_per_million_miRNA_mapped数值与朋友在生物公司做的数值不一样呢?

用简易TCGA下载工具下载的miRNA-Seq-BCGSC miRNA Profiling数据,其中reads_per_million_miRNA_mapped数值与朋友在生物公司做的数值不一样呢?attachments-2017-12-609C1YSM5a2cbeffb3ccf.JPGattachments-2017-12-t3RN1RHY5a2cbf06644a7.JPG

导致最后分析出来的结果,我用DECenter-V4分析出来的是down-Regulated,而他那头公司出来的是Up-Regulated。。。

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

首先确定一下你朋友那边数据是否做过标准化,TCGA下载工具下载的是初始的数值,没有做过其他处理

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  • pasu0203 提出于 2017-12-10 12:59

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