3 用DECenter V4分析miRNA-Seq-BCGSC miRNA Profiling里的reads_per_million_miRNA_mapped数据选用哪个方法?

用DECenter V4分析miRNA-Seq-BCGSC miRNA Profiling里的reads_per_million_miRNA_mapped数据选用哪个方法?

用limma可以吗?每次都得复制到cmd里才能用。

用其他那个几个(edgr、deseq2、配对T、T检验等)怎么都分析不了呢?最好有哪位大神能讲讲这几个方法都适用于简易下载工具里下载下来的哪些数据。赶集不及~


请先 登录 后评论

1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

edgR和deseq2是不支持FPKM的数据的,T检验应该是可以的,除非是你数据矩阵中存在很多0等异常情况

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,3314 浏览
  • pasu0203 提出于 2017-12-13 21:30

相似问题