以文章为例，直入主题。来自Oncotarget的你，PMID: 29050278。整篇文章最重要的一步就是选择了GSE54129这个数据集，后续的分析都不难。很难想象一个包含132个胃癌样本的数据集居然没有做过差异分析，GO和KEGG，就这样安安静静地待在那里。所以这种存在但是无人分析过的数据集是怎么找到的呢？一个一个人工筛的吗？
还有一些文章会选三个数据集，然后去差异表达的交集继续分析。而且文章中永远也不会提一笔这三个数据集是根据什么选的。加入某文章用的是A,B,C数据集，那是不是说我用A,F,G或者B,J,L做同样的分析也可以发文章（前提是结果不同）？
包括论坛上的一些帖子也没有提及GEO数据集是如何选取的。感谢赐教。
