求推荐酶蛋白修饰可能性预测的分析软件或在线分析工具

想找寻相关软件或在线分析工具,用于对原核生物中相关蛋白的酶蛋白修饰存在可能性进行预测,最好是可以同时预测多种修饰的,但如果是单独的也可以~万分感激!

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

推荐  PhosphoSitePlus

他是一个蛋白质磷酸化位点的数据库网站,里面保存了大量人类,小鼠和大鼠的蛋白质磷酸化位点信息。这些信息主要来自目前已有的一些高通量和低通量分析数据,每个数据都标明了来源的文章或者筛选数据标识号,并且链接有蛋白结构,信号通路,其他修饰,甚至抗体等相关信息。当然,也可以通过激酶的角度去找信息,激酶的已知底物也都会被收录到这个数据库,同样表明了来源和相关数据。而且数据库会根据这些底物的序列的规律,制作出一张consensus site的统计图,这样就可以用来预测一些蛋白质的位点。

引用自科学网:http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=382793&do=blog&id=462577

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  • Tracy 提出于 2017-12-20 19:23

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