我在生信人工具下载了rna-count和rna-fpkm的文件，各自合并文件之后转换基因名，得到全基因、lncrna、mrna的count矩阵和全基因的fpkm矩阵，可是我想要lncrna的fpkm值，通过匹配处理之后发现一万五的lncrna count的基因名在全基因的fpkm只找到五千是一样的，请问剩下没有匹配到fpkm值的一万lncrna是怎么回事，生信人工具上下载的数据跟在官网上下载分析的会有多大的出入，我直接用有点怕怕的
没有明白你的意思，counts矩阵和fpkm矩阵中的ENSG编号都是一样的，小工具有提供提取lncRNA和编码基因的功能,大约有一万八左右的编码基因和一万五左右的lncRNA，他是根据biomart进行转换的，不知道你纠结的点在哪里
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