GEO下载数据

从GEO上下载数据,能否事先知道某种癌症的一套数据既含有临床数据中的生存时间和生存状态,又能够转换为gene symbol,。如果不能。就要一套一套的下载下来然后在检查吗?目前已经下载了很多套数据,但是上面的患者信息都不全。

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1 个回答

disciplinant - 登山爱好者

是的,GEO中的数据不像TCGA那么完整规范;毕竟不是一个级别的。GEO都是个人或课题组做的芯片或测序数据,临床信息有的有,有的就没有,不全太常见了。就是下载很多也不见得会得到多少信息。

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  • 小苹果 提出于 2018-01-12 12:33

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