5 请问数据TCGA简易工具下载的miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling是否区分3p和5p序列?

请问数据TCGA简易工具下载的miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling是否区分3p和5p序列,如果不区分的话,那我要做mirna和靶基因的负相关性,只能用miRNA Profiling的数据吗?miRNA Profiling(isoform)是否有3p和5P的数据?miRNA Profiling(isoform)是否有3p和5P的数据?

请先 登录 后评论

3 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling不区分的,isoform里有3p、5p数据,可用最新版的TCGA简易下载工具V10进行合并提取

请先 登录 后评论
顶顶

老师,麻烦问下,如何把我从isoform中的3p和5p结合到我用profiling筛出来的mirna呢?我想找mirna对应的mrna

请先 登录 后评论
tiandong_ansuan

老师,我想问下BCGSC miRNA Profiling.isoform和BCGSC miRNA Profiling有什么区别

请先 登录 后评论
  • 4 关注
  • 2 收藏,5890 浏览
  • 邓见青 提出于 2018-01-29 17:58

相似问题