15 请问有没有生物信息学的方法可以用于找已知基因的互作基因(蛋白)?

我有一个感兴趣的基因a,请问有没有办法通过分析公共数据(比如rna-seq?)来筛它的相互作用基因?例如做基因a和其他基因的相关性分析?十分感谢!


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2 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

你可以从两方面来做:

1、通过已有蛋白互作数据库中的互作数据筛选与这个基因具有可能互作的基因

2、通过基因表达的相关性,在多个转录组数据集进行计算他们的相关性,选择相关性高的基因

3、前两步的交集

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王宇 - 生物信息

简单点的试试STRING数据库

https://string-db.org/cgi/input.pl

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  • 提出于 2018-02-21 18:57