关于TCGA中GBM数据的使用

请问如何用TCGA中数据来验证胶质瘤的MGMT启动子甲基化与预后的关系?求老师们指点~

请先 登录 后评论

1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

给你一个例子:

已有研究表明MGMT基因启动子区域cpg岛甲基化对这些患者的化疗药物敏感性具有重要的意义。我们选择了77个样本,分析这些样本中MGMT基因的启动子区域cpg岛的甲基化水平,根据每个样本的甲基化水平进行排秩,选择cpg岛内的cpg位点甲基化水平中位数大于0.35的定义为高甲基化(HighMethy),小于0.35的定位为低甲基化(LowMethy),以此来对样本进行分类。

然后进行KM分析

请先 登录 后评论
  • 3 关注
  • 2 收藏,4163 浏览
  • Funn_nny 提出于 2017-06-14 08:42

相似问题