在用DECenter做肺癌miRNA差异表达分析时总是出现,数据有重复,可我并没有找到重复样本,怎么破?

在用DECenter做肺癌miRNA差异表达分析时总是出现,数据有重复,可我并没有找到重复样本,怎么破?

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软件提示样本组有重复,我的样本组的名字都是下载文件时每个样本自己的名字,我查找过,没有重复的样本,即使是同一患者的癌组织和癌旁组织有重复的我也把癌组织给去掉了,也有重复,是什么情况?应该怎么解决?

另外,为什么有时候会出现如下图所示的情况呢?

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望老师能指教一二,生信菜鸟的殷切盼望。

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

首先你的提示是row.names有重复,也就是行里面有重复

其次你的样本分组那个文件出现了空行,隔一行空一行,我猜测你的这个文本文件不太对,你试试用文本打开看看,有可能是编码的问题,用Excel保存TXT文件的时候一定要仔细看不要选择Unicode编码的TXT

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