TCGA=matrix(as.numeric(as.matrix(GeneExp)),nrow=nrow(GeneExp),dimnames=list(rownames(GeneExp),colnames(GeneExp)))> TCGA=averegs(TCGA)Error in averegs(TCGA) : 没有"averegs"这个函数>
请问TCGA数据库中的表达谱数据是不是在化疗前测得的？如果是的话，请问是从什么地方得知的?我在相关的文献和官网上都没有找到相关描述，如果有哪位知道的话还请指点一下，谢谢！
我想在TCGA数据库中筛选胃癌MSI和MSS的样本。
TCGA简易下载工具下载好数据还未合并就关了，重新打开就得重新下载再合并，这要怎么解决，能否重新打开马上合并，具体怎么操作？谢谢！
用SangerBox下载TCGA数据，通常会报错。往往就中止了，不知道怎么回事
我有一个基因，他只在肝脏高表达，pancancer的图显示他在肝癌和胆管癌里面都有高表达。请问可以肝癌和胆管癌一起分析吗？因为单独分析肝癌结果不太好……
已下好clinical和profiling的数据，如何进行匹配，求代码指导！！！！！是直接根据表达量的变量名和clinical中的变量名比对后合并吗？
之前群里的大师给回复说，TCGA简易下载软件下载的RNA数据合并并且转换之后并未做log处理，我想了解一下，合并之后的数据是需要做quantile normalize log2么？这个怎么来做？因为不会R语言这套东西，所以想了解一下有没有Excel解决...
请教大神们，获取TCGA RNA-Seq后如何分离mRNA跟lncRNA 还可以进一步分离出其他ncRNA吗？
祝sir，我做胃癌TCGA差异分析，想重点看一下配对癌与癌旁组织表达差异，但有个别病例没有对应的癌组织数据（32个癌旁组织，其中5例没找到对应的癌组织数据），这是怎么回事？