我用TCGA简易下载工具下载了肝癌的microRNA数据，包括正常组织和原发肿瘤两份数据。下载文件合并以后，将得到的数据复制粘贴到EXCEL表格中，把两份数据的两列microRNA名字进行比对，发现有个别microRNA错位，导致两份数据无法进...
用DECenter分析TCGA里的miRNA数据时报错 some values in assay are not integers ，请问怎么解决呢？
基本掌握了下载工具和合并的方法，请问如何在论文方法部分简单描述使用了TCGA下载工具下载的RNA-Seq呢？我指下载工具背后具体大概用了什么软件和package呢？谢谢
最近刚开始研究TCGA的数据，想做一些分析工作。 利用TCGA下载工具V9下载了几个癌症的miRNA数据（BCGSC miRNA profiling），下载之后，看到了里面的read_count和reads_per_million_miRNA_mapped的值。 我想利用read_count求出RPKM，于是我学习了一...
请教各位，怎么利用TCGA的数据，分析A基因在B基因高表达组和低表达组的表达水平？请给出具体的分析过程，谢谢。
TCGA数据库中下载了头颈部鳞状细胞癌的数据，怎么只提取鼻咽癌的数据？
sangerbox分析TCGA数据库GSEA富集分析后的NES值，p值及FDR值再哪里怎么看
小工具下载的HTSeq-FPKM的数据合并后的样本量和TCGA中的case数不一样，下载下来的更多，我下的UCEC的表达量数据有586个，TCGA网站的共560个样本的数据
用TCGA经分析后的提取的基因，然后在GEO中进行验证，两个平台的文件用什么方法进行标准化，因为我做生存分析的时候TCGA的risk score老师要比GEO的risk score 低