TCGA下载的GBM数据中哪3个文件是somatic mutation，CNV和gene expression，如何把前两者转换成0-1矩阵

用TCGA简易下载工具下载TARGET的相关数据时，为什么clinical的编号和RNA的对应不上，每个样本的编号都不同？

解决 想问一下TCGA数据库里面有正常组织的RNA测序数据么，一个老师告诉我有我没找到。求各位大佬给个帮助

请问老师，从TCGA下载临床数据，想和前面的miRNA表达谱一起进行生存分析，我应该下载哪个格式的，三种有差别吗，谢谢老师啦。

解决 用简易下载工具下载的癌和癌旁病人信息数据为何和直接从TCGA下载的数据差两个数，为何存在不一致？求解答，谢谢

从GEO下载的RNAseq数据，转换后为啥不能用DECenter找差异，提示limma包缺失，而我直接从盒子里下载的TCGA就可以

TCGA简易工具下下来的CNV数据中的segment_mean是和正常组织比对之后的gain/loss的倍数吗？能否直接拿来作图？

TCGA简易下载工具下下来的CNV数据中的segment_mean是和正常组织比对之后gain/loss的倍数吗？ 还要做其他的分析吗？能否直接拿来作图？

在ucsc下载的tcga数据库，怎样简单的用excel做癌组织与正常组织的转录组差异表达分析

比如我下载了brest invasive cancer,里面的BRCA geen expression (IlluminaHiseq)文件，用excel做某个基因在癌组织相对于正常组织表达量上升或降低百分比，有具体详细的步骤做法教程吗，完全是个生信的小白，求大神帮忙

TCGA简易下载工具下载的RNA-seq counts在用edgeR分析差异基因的时候需要先把数据log2处理吗

tcga简易下载工具V10下载胃腺癌数据HT-Seq FPKM(407），下载了一会就停住再也不动了，咋解决？

A1_OS这个变量是随访时间，TCGA项目是2005年开始的，这个项目一共10来年里面的随访时间为啥有8000多天的？谢谢

利用生信人TCGA下载工具获取基因表达数据，下载前看到共有529个样本，合并后的数据只有256个样本名，为什么呢？

利用生信人TCGA下载工具获取基因表达数据，下载前看到共有529个样本，下载完529个压缩包合并后，发现EXCEL中只有256个样本，为什么呢？ 临床数据下载前是522个样本，下载合并后有522个样本。这说明有一部分随访的病人没有进...

用TCGA简易下载工具下载的miRNA的标本名中出现如图所示的例如_Rep445是什么意思，怎么把它去掉呢？

请问在TCGA下载的miRNA数据中hsa-mir-21怎么转换为相应的基因名称？还有甲基化的数据类似cg00003578怎么转换？

请问我用TCGA下载的数据进行sanger box工具里的GESA分析，点了批量运行后保存文件没反应，请问你是怎么解决的？谢谢！