TCGA下载下来的数据应该是包括mRNA和ncRNA，经过数据整合和ID转换之后，基因数变少了，是少了哪一部分RNA数据？
TCGA简易下载工具双击选择数据集后 一直显示正在检索 而没有出现数据vpn也是开着的
请问大神：TCGA中甲基化数据分析要用哪个R包？limma还是edgeR就可以？主要是450K的数据特别大，电脑跑不动？如何解决
请问大神：TCGA中甲基化数据分析要用哪个R包？limma还是edgeR就可以？主要是450K的数据特别大，电脑跑不动？如何解决?
大家好，我下载了TCGA的FPKM和count数据，做了一些分析再加上其他的写了一篇文章在投稿，但是审稿人问我：你使用的数据，是单细胞RNA-seq数据吗？对细胞进行了多少次读取？ 数据的质量如何？ 比较转录组分析使用哪种算法？ ...
请问老师，TCGA中的miRNA表达数据一般来说是什么时间采集的，比如是癌症刚诊断时，手术时，还是癌症发展到晚期的时候采集的？因为这涉及到癌症预后与表达的真实关系。 谢谢您的解答！
初学者提问： 大佬们好，我最近在学用R对TCGA下载的数据进行生存分析，用的是survival包，想问一下TCGA下载的FPKM数据是可以直接进行生存分析么？还是需要进行一些处理？那是什么样的处理呢？比如过滤过低表达的数据？
r包或者思路求解
为什么简易下载工具里没有肺腺癌LUAD的数据呢
请问一下TCGA 下载的CNV数据如何找到对应的基因？如何进行下一步分析？有没有基于Windows系统的分析方法？
用简易TCGA下载工具，clinicalFull出错，显示“合并提取所有临床随访信息出现错误，请检查文件”，已经重新试了文件下载流程等，还是这样，求问怎么办呢，谢谢谢谢
我下载的某种肿瘤的临床数据前7列有总结，如下图所示 但是和后面的vital_status对比了下，有些不一样 我该用哪个？