分析TCGA中某基因的差异表达,DEcenter给出了均值,如何计算标准差
文献为:TANRIC: An interactive open platform to explore the function of lncRNAs in cancer 发表在:Cancer Res. 2015 September 15 截图:
大神,本人刚刚接触生信,想咨询一个问题,tcga如何下载某一特定类型的肿瘤数据,我想下载一下口腔癌或者舌癌的数据,但是里面搜到的数据是头颈鳞癌,打开clinical数据不知如何筛选,查到的数据BA,BB不知道具体在是哪边...
如何将TCGA中的临床数据和GSE的GSM样本信息对应整合起来
一、各位大侠,小白想用R下载TCGA测序数据进行癌和癌旁基因表达分析,已下载RTCGAToolbox,R3.6.1。 二、下载命令为 Data=getFirehoseData(dataset="THCA",runDate="20160128",clinical=TRUE,RNASeqGene=TRUE,RNAArray=TRUE,Mutation=TRUE) 出错代码为 Erro...
如何处理TCGA count矩阵中重复的基因名,想让基因名唯一,求代码。
... 您好! 我是近期开始学习生信的新手,最近用的TCGA数据都是用V2版下载工具下载的,但V2版无法解析完整的临床信息。 之前看到V6版TCGA能够完整解析,但网上到处都下载不到,希望前辈能提供V6版的下载链接或者下载方...
生信盒子TCGA下载工具不能下载GEO数据,输入GSE编号,点击检索没有反应。
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目的是在TCGA数据库中下载关于乳腺癌的正常和肿瘤的基因表达谱数据