TCGA简易下载工具v14中copy number variation与copy number variation.nocnv的区别
简易TCGA下载工具 临床解析步骤 用简易TCGA下载工具,clinicalFull出错,显示“合并提取所有临床随访信息出现错误,请检查文件”,已经重新试了文件下载流程等,还是这样,求问怎么办呢,谢谢谢谢
都表示什么意思?求解答。
tcga显示共有162个癌组织,81个腺癌样本,80个鳞癌样本,还有一个样本类型为Cystic, Mucinous and Serous Neoplasms(样本号为TCGA-L5-A43C)。工具下载(161个样本)的信息中,该样本属于腺癌类型。另外,官网的腺癌中有三个样本,在工具...
我已下载“TCGA简易下载工具-V8“,但是与使用时,提示与32位操作系统不兼容,所以求知于您,麻烦了!
目前在做肿瘤方向的研究,从TCGA数据库下载的metadata文件和xml文件里都没找到与肿瘤转移相关的信息,想求助一下,肿瘤转移信息的标签是什么?应该搜索什么标签才能找到临床信息文件内的肿瘤转移信息?谢谢
请问在这里下载的数据是可以直接用于生存分析的reads数码?需要归一化或其他处理吗? 合并后的数据第一列是什么意思?
祝老师你好,我前天按protocal在生信人下载了TCGA的数据,但是在LncRNA_ID转换的时候,发现绝大多数LncRNA_ID没有成功转换,大部分依旧是 ENSG开头的探针名,是否后台注释文件有问题?如下图,谢谢解答
如题,我用盒子里的GSEA工具分析TCGA的数据总是不成功,分组文件是txt的分成2组,表达文件是下载的,ensemble号的FPKM数据,做不出来,请教各位大神
按网上要求进行数据下载,但运行gdc-client download -m gdc_manifest_20180605_084918.txt以后报错出不来结果是怎么回事呢?