简易下载工具V8点击样本类型后,点击检索,一直检索不出来,怎么回事。
使用Decener的EdgeR或Limma分析胰腺癌差异表达的基因,采用http://gepia.cancer-pku.cn进行验证,发现上调的基因还比较准确,但是下调的基因非常不准确,几乎在GEPIA里都是上调的,这是怎么一回事?
请问TCGA数据库中的表达谱数据是不是在化疗前测得的?如果是的话,请问是从什么地方得知的?我在相关的文献和官网上都没有找到相关描述,如果有哪位知道的话还请指点一下,谢谢!
首先TCGA下载的RNA-seq数据是ensembl的ID,里面包含了六万多个转录本数据,本工具主要是对该数据进行一些基本的转换: 1、提取其中的蛋白编码基因表达谱 2、提取其中的lncRNA表达谱 3、提取其中的假基因表达谱 数据输入要求: ...