...分享了 《GEO数据的下载方法》 小编今天给大家分享 《TCGA数据下载的终极篇》 作为GEO数据的姊妹TCGA数据库中的数据也是生信分析常用的数据之一。 TCGA(The Cancer Genome Atlas )是由National Cancer Institute ( NCI, 美国国家癌症研究所)...
因为下载后整理后的文件，代表normal的列是杂乱分布的，而我要用edgr包处理，我就改了一下列的顺序，把normal放前面，cancer放后面，然后就报错了，
第一个是显示有1600多个，但我只能下载900个文件 第二个是因为不能用简易工具合并，那应该怎么下一步分析，求给点思路，谢谢
请问下count和fpkm区别在哪，用的r包有什么不同，谢谢！
COX批量生存中说https://www.shengxin.ren/article/209 死亡时间和最后一次随访时间是互斥的，有死亡时间就木有最后随访时间，木有死亡时间的就有最后随访时间。可是我下载卵巢癌的数据并不是那样子啊，有的两个都有是一样的；但...
TCGA中下载的转录组数据包含多种RNA，其中包含mRNA和miRNA，该如何区分不同的RNA，同时提取mRNA的数据呢，新手，还望多多指教下！多谢
想从下载工具里获得TCGA中的RNA表达数据，在可下载资源列表里给出的选项RNA-seq有好几种，应该选哪种数据进行分析？后续用于差异基因分析和生存分析的 有counts.,FPKM-UQ, FPKM
我通过生信人小工具下载了TCGA乳腺癌的详细临床数据，在查看其中的临床病理信息中发现，免疫组化指标有好几列数据，而且部分样本的免疫组化指标的阴性和阳性有时会冲突，特别是HER的免疫组化，FISH检测，还有一列叫做HER2...
LGG（brain low grade glioma）和GBM （glioblastoma）都属于脑胶质瘤，如果希望进行分析的话，两种疾病的counts 数据，fpkm 数据（通过小工具下载）。 是否可以合并在一起进行分析？
怎么从TCGA下载的数据中提取lncRNA的信息？求详细步骤，恳请大侠指点详细步骤
各位大佬，你们好，我用SangerBox下载TCGA某种肿瘤的转录本数据合并后，发现样本ID并不是那种标准的好几段，好像有几处字段缺失，所以无法区分癌症和癌旁组织，请问大家是如何区分的？下载后如上图 和这有些不同
合并时提示“无法合并，格式错误”，请问怎么处理