整理出来,recurrence一列是空白,而后面personNeoplasmCancerStatus里有的with tumor的病例recurrenceTime却是空白。请问终点事件到底以哪个为准?谢谢!!
请问为什么我下载安装sangerbox后,也升级了,但是却显示本地无法连接TCGA服务器!远程代理也获取失败?
想在tcga数据库中查肝癌病人肿瘤中某个目标基因的RNA表达值然后进行预后分析,发现给出的Z-score大多数为负数,oncoprint页面给出只有2.2%病例表达上调,所以是要用这2.2%病例作为高表达组,剩余所有病例作为低表达组做预后分...
老师好,我用了TCGA简易下载工具下载肝癌的clinical的数据,文件中直接有OS的数据,我还想提取RFS的数据,请问我应该怎么样计算得到RFS的数据呢,是一列follow_ups.follow_up.new_tumor_events.new_tumor_event.days_to_new_tumor_event_after_initial_treat...
...”里还有一部分显示是 lung 的病人。 还有就是我直接在 TCGA 数据库里搜索某病人编号时,发现可以下载临床信息,我就下载了,这里面只有 85 个病人的信息,发现里面又多了一些显示转移的病人。 这个文件是指最近一次随...
分析某一miRNA在胃癌和癌旁的表达差异,分别提取表达矩阵里癌和癌旁的数据后,需要对表达数据进行如何处理?