假如下载TCGA中肝癌metastatic数据,那么下载的是其他癌症转移成肝癌的这种数据,还是肝癌转移为其他癌症的这种呢?
用盒子下载的TCGA数据是level几?需要标准化还是直接分析差异就行?
简易TCGA下载工具下载的数据是不是因为来自不同的芯片含有不同探针标识符
偶然遇到一个项目要做某个癌症的TCGA突变频谱: 找遍各个TCGA数据下载的地方都找不着,话说这里https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/TCGA+MAF+Files 可以找到,但是也没下载下来,不知道是不是没有用了。 最后在http://firebrowse.org/?cohor...
...的及时解答。我想请教一下 我用在线版的sangerbox下载了TCGA转录组数据 打开之后发现所有的样品都是第4位以0开头的癌组织 没有癌旁组织。我想做差异分析,所以同时需要癌组织和癌旁组织。请问是TCGA数据库里只有癌组织样本...
...及时解答。我想再请教一下 我用在线版的sangerbox下载了TCGA转录组数据 打开之后发现所有的样品都是第4位以0开头的癌组织 没有癌旁组织。我想做差异分析,所以同时需要癌组织和癌旁组织。请问是TCGA数据库里只有癌组织样本...
求一份脚本,可以从TCGA的clinical中提取个各种临床信息