各位大神,请教一下,我下载TCGA数据并合并文件以后,用excel打开matrix文件,结果是这样,请问我应该怎么做才能处理这些数据呢?
一、进行TCGA数据下载一个maf格式的mutation,接受中有mutect,muse,vanscan,somaticsniper,这四个文件有什么联系。下载的MAF文件可能有两种格式 ,可能是47列,或者120列,这个对后续分析有什么影响? 二、进行TCGA数据下载后这个仅仅有...
如下图所示,在使用TCGA合并文件功能后,出现多个merge文件,请问他们之间有什么区别,是不是只需要Merge_matrix文件?谢谢
能够搜索到转录本信息,但是临床随访信息无法找到,看TCGA官网显示的TCGA-OS是control内容,是因为这个原因无法找到吗?但之前的相关信息说TCGA的control也能下载下来?
TCGA 简易小工具下载的CNV 片段数为什么和 官网的数目不一致,下载出的是1074个片段,官网给出masked copy number segment 和 copy number segment 都是906,另外还想请问这个masked copy number segment 是什么意思?谢谢!
TCGA下载工具不能下载miRNA数据
TCGA产生背景 目前人们研究最多的疾病非癌症莫属。从人类基因组计划完成后,癌症研究也早已步入基因组学时代,正因如此,人们急需一个能整合多种癌症基因组测序数据的功能强大的数据库平台来直接准确地获得自...
我想利用TCGA/SEER数据库发表SCI文章,但我是菜鸟。请教大家是否有免费的教学视频之类的可以学习!谢谢!
使用sangerbox的tcga下载工具,左边“双击选择TCGA数据集”处数据集显示空白,之前有列表的,这次打开列表显示不出来,求助!!
各位老师好! 我利用SangerBox的TCGA简易下载工具得到的TCGA数据想在文章中使用,请问在材料与方法中要如何引用SangerBox TCGA简易下载工具?谢谢老师!
这是我下载的RNA-Seq数据,并且合并了, 我想问一下这里的0是真值 还是代表缺失值NA呀?
请问TCGA下载工具V9在哪里下载,谢谢
使用TCGA简易下载工具选择需要样本类型,单击重新检索按钮,一直检索不出来,怎么办