表达芯片数据预处理四部曲-N,T,B,Q(normalization,transformation,bac
如果得到了一个可靠的表达矩阵，那么后续的一切分析都不是事，非常简单，分分钟做几百个差异分析，富集分析。但是，如果保证你的表达矩阵是可靠的呢？毕竟一般人也就是从GEO里面直接下载作者处...
如果得到了一个可靠的表达矩阵，那么后续的一切分析都不是事，非常简单，分分钟做几百个差异分析，富集分析。
但是，如果保证你的表达矩阵是可靠的呢？
毕竟一般人也就是从GEO里面直接下载作者处理好的表达矩阵了，你敢确定人家做的是对的？
稍微懂一点的也许会下载affymetrix或者illumina芯片的原始文件，比如cel格式的等等，自己用R包来转换成表达矩阵。
你知道从芯片到表达矩阵，中间到底经历了什么吗？？？
就是这4个步骤：
N,T,B,Q(normalization,transformation,backgroud correction,qulity control)
只是大部分情况下，都是被一个成功的R包包装成了一个函数！
你会吗？？？
- 发表于 2017-08-15 07:39
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- 分类：方案研究
