HeatmapCluster工具使用案例
本小工具无需您懂得R语言等繁琐的计算机语言，只需您的一份表达矩阵文件，瞬间帮您完成梦寐以求的Heatmap图片！！简单便捷，生信人出品，精品中的极品！生信人助您成为SCI达人！
1、软件下载地址！
http://gap.shengxin.ren/tool/3/
2、双击运行主程序“HeatmapCluster.exe”，打开界面如下：
3、点击右侧“选择矩阵文件”（这里的矩阵文件为表达矩阵，对于行和列，无特殊要求，怎么开心怎么来）。这里，我们举例说明，矩阵文件如下所示（列名为sample，200例，行名为gene，11个）：
4、瞬间生成Heatmap如下（具体运行时间根据您的电脑配置）：
5、上面这个图很难看，并且很多参数需要调整，因此更改参数的选项如下：
6、更改颜色，点击这三个颜色框，可以随意选择颜色，这里举例说明选择蓝-白-红，三种颜色。
7、是否进行cluster？则选择“RowCluster”或者“ColCluster”。
8、是否进行Z-score？则选择按照Row还是Col进行Z变换，例子中，我们按照Row进行Z变换。
9、是否显示Row名字或者Col名字？则选择Show按钮。
10、选择聚类的方式？有“欧氏距离”和“皮尔森相关系数”两个选项。
11、调整完参数后，生成如下：
12、点击右侧保存相关按钮，建议保存为PDF格式，“绘图”按钮其实就是“刷新”功能啦！
13、最终保存的图像为下图（蓝-白-红）：
【来自生信人的忠实粉丝分享_杭州薛之谦】
- 发表于 2017-09-08 11:41
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- 分类：软件工具
