八种免疫浸润评分的简易计算工具
肿瘤免疫已经是热点中的热点，逐渐成为数据分析中的标准分析了，在这里我们封装了八种常见的免疫微环境评分的计算方法，界面非常简单，输入的是表达谱矩阵，行为基因，列为样本。
使用该工具是...
肿瘤免疫已经是热点中的热点，逐渐成为数据分析中的标准分析了，在这里我们封装了八种常见的免疫微环境评分的计算方法，界面非常简单，输入的是表达谱矩阵，行为基因(必须是人类的GeneSymbol)，列为样本。
使用该工具是非常简单的，结果也非常简单
以上是整个工具，实在是没啥讲的，但是 要针对每个软件的结果进行解读就需要展开说明了，写作模板如下：
IOBR[DOI:10.3389/fimmu.2021.687975]是一款免疫肿瘤生物学研究的计算工具，在这里基于我们的表达谱使用R软件包IOBR选择了【CIBERSORT（DOI:10.1038/nmeth.3337）,ESTIMATE (DOI:10.1038/ncomms3612) ,quanTIseq (DOI:10.1186/s13073-019-0638-6), TIMER(DOI:10.1186/s13059-016-1028-7), IPS:10.1016/j.celrep.2016.12.019,MCPCounter (DOI:10.1186/s13059-016-1070-5),xCell (DOI: 10.1186/s13059-017-1349-1) ,EPIC (DOI:10.7554/eLife.26476)】方法计算了每个样本的(XXX种)免疫浸润细胞评分。
每一种方法 展开 后 网上 都有 很多教程，请自行百度即可
- 发表于 2021-07-23 10:50
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- 分类：软件工具
