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PCA、UMAP、tSNE是常见的几种降维方法,具体原理可以参考:常见的PCA、tSNE、UMAP降维及聚类基本原理及代码实例
在这里我们开发了一个简易的PCA、tSNE、UMAP的一键化工具,用来快速的做PCA、tSNE、UMAP分析,输入界面如下:
输入一个表达矩阵就可以了,样本分组这个信息是用来画图的颜色标记的
点击按钮-》开始分析-》输入 任务名称
点击确定后,等待任务完成
载入结果后 可以对结果进行调整,如下:
此外 还有运行日志和写作指导:
几种主要的图片展示如下:
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