GEO数据表达矩阵标准化前后箱线图制作

以文章Identification of differentially expressed genes and signaling pathways in ovarian cancer by integrated bioinformatics analysis的Figure1为例,简单几分钟制作如下图效果: 基本...

以文章Identification of differentially expressed genes and signaling pathways in ovarian cancer by integrated bioinformatics analysis的Figure1为例,简单几分钟制作如下图效果:

attachments-2018-05-kO5i4zKc5b09797cb4d77.png基本思路:

attachments-2018-05-jB2XI9HH5b0979c2d78c8.pngattachments-2018-05-3bgbBv9L5b0979c411437.png

使用的工具

1、GEO便捷转换器 提取表达矩阵

attachments-2018-05-OEjkQyoU5b097a1c68fac.png

2、Boxplot简易绘制工具制作箱线图

attachments-2018-05-abA068Bm5b097a50d0023.png得到数据标准化前的箱线图

attachments-2018-05-etmbEeyY5b097a8e4539f.png

3、使用简易数据标准化工具对数据进行分位数标准化

attachments-2018-05-ZHyOXxGF5b097ab69acc5.png

4、使用Boxplot简易绘制工具重复第二步

attachments-2018-05-F8FpDr7x5b097aee6344c.png

5、进一步使用AI对图片进行修理,最终得到发表级图片

attachments-2018-05-k1Uitk7m5b097b2acfbc0.png简单实用,灵活组合小工具,玩出新高度。

  • 发表于 2018-05-26 23:22
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