在GEO数据库如何找带有预后信息的数据?一分钟搞定,适用于找任何的样本特征数据

GEO数据库是目前基因表达谱数据数据库之一、里面包含了各种物种的各种测序和芯片平台的数据。详情介绍可以参考这篇文章:https://shengxin.ren/article/454,在这里我们主要介绍怎么快速的获取 ...

GEO数据库是目前基因表达谱数据数据库之一、里面包含了各种物种的各种测序和芯片平台的数据。详情介绍可以参考这篇文章:https://shengxin.ren/article/454,在这里我们主要介绍怎么快速的获取 GEO数据及样本信息,怎么快速检索出 带有指定 样本信息的数据集。

第一步:打开神器:http://sangerbox.com/Information 可以看到界面如下:

attachments-2020-02-l7AnKroR5e3cc34855140.png

第二部开始检索数据,以 口腔癌 为例,检索带复发的数据如下:

attachments-2020-02-IZLDoyLz5e3cca7423966.png

attachments-2020-02-dwkbnvLG5e3cca5299d6e.png

第三步:打开数据GSE84846详情页:http://sangerbox.com/Info?Id=GSE84846

attachments-2020-02-YZgWvkjF5e3ccbb396c72.png第四部:选择相应的功能进行下一步操作




  • 发表于 2020-02-07 10:32
  • 阅读 ( 15545 )
  • 分类:软件工具

1 条评论

请先 登录 后评论
不写代码的码农
祝让飞

生物信息工程师

118 篇文章

作家榜 »

  1. 祝让飞 118 文章
  2. 柚子 91 文章
  3. 刘永鑫 64 文章
  4. admin 57 文章
  5. 生信分析流 55 文章
  6. SXR 44 文章
  7. 张海伦 31 文章
  8. 爽儿 25 文章