在GEO数据库如何找带有预后信息的数据?一分钟搞定,适用于找任何的样本特征数据

GEO数据库是目前基因表达谱数据数据库之一、里面包含了各种物种的各种测序和芯片平台的数据。详情介绍可以参考这篇文章:https://shengxin.ren/article/454,在这里我们主要介绍怎么快速的获取 ...

GEO数据库是目前基因表达谱数据数据库之一、里面包含了各种物种的各种测序和芯片平台的数据。详情介绍可以参考这篇文章:https://shengxin.ren/article/454,在这里我们主要介绍怎么快速的获取 GEO数据及样本信息,怎么快速检索出 带有指定 样本信息的数据集。

第一步:打开神器:http://sangerbox.com/Information 可以看到界面如下:

attachments-2020-02-l7AnKroR5e3cc34855140.png

第二部开始检索数据,以 口腔癌 为例,检索带复发的数据如下:

attachments-2020-02-IZLDoyLz5e3cca7423966.png

attachments-2020-02-dwkbnvLG5e3cca5299d6e.png

第三步:打开数据GSE84846详情页:http://sangerbox.com/Info?Id=GSE84846

attachments-2020-02-YZgWvkjF5e3ccbb396c72.png第四部:选择相应的功能进行下一步操作




  • 发表于 2020-02-07 10:32
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  • 分类:软件工具

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祝让飞

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