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GEO数据库是目前基因表达谱数据数据库之一、里面包含了各种物种的各种测序和芯片平台的数据。详情介绍可以参考这篇文章:https://shengxin.ren/article/454,在这里我们主要介绍怎么快速的获取 GEO数据及样本信息,怎么快速检索出 带有指定 样本信息的数据集。
第一步:打开神器:http://sangerbox.com/Information 可以看到界面如下:
第二部开始检索数据,以 口腔癌 为例,检索带复发的数据如下:
第三步:打开数据GSE84846详情页:http://sangerbox.com/Info?Id=GSE84846
第四部:选择相应的功能进行下一步操作
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