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如何处理TCGA非数值型临床数据
我记得原帖里就是非数值变量吧，做的是乳腺癌亚型与基因表达的关联，如果是二分类变量的话，写成0，1就可以了， 同样可以计算相关性的。WGCNA那本书上用的是肝癌小鼠的例子，是和体重挂钩的。 如果是其他分类有标度的话，我觉得你只需要根据数据类型是否有序，给一个标度就可以了，因为最后刻画的是相关性，我觉得应该没...
回答于 2017-07-23 08:03
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TCGA简易下载工具RNASeq的htseq-count数据是你们自己根据rsem值...
官网也会提供count呀，在没发现这个工具前，我一直都是在网上下的count。
回答于 2017-07-21 09:01