Dakun 的回答 - 生信人

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能否用TCGA中GBM的正常样本和LGG的肿瘤样本合并在一起，然后做差...

不可以，批次效应

回答于 2019-09-06 15:11

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同样的方法建模，不是要用同样的值

回答于 2019-08-06 09:55

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富集的基因太少，这种后果不能用

回答于 2019-07-12 14:23

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你可以选starbase这种，选出很多潜在靶基因，然后miR和靶基因利用样本或者公共数据看相关性

回答于 2019-07-12 14:21

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一般是标准化过的，看下是否需要log2一下吧

回答于 2019-07-12 14:19

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这。。。你确实你是学生物的？。。。

回答于 2019-07-12 14:18

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差异基因是转录水平的，是RNA

回答于 2019-07-12 14:16

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网页改版了很多文献的是旧版的应该，你可以用新的弄个热图还是可以的，我弃用这个数据库了多了没研究

回答于 2019-07-01 20:11

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请问解决了吗？我也遇到这个问题不会使用

回答于 2019-05-15 22:12

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好像是R包survival的predict函数可以做，但是type是不是选risk我就不知道了，看文章是把测试集的coefficient用到验证集中，并且risk score的cutoff也是和测试集一样。如果你知道怎么做的话请告诉我，互相分享

回答于 2019-03-29 07:12