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GEO数据基因注释（GPL17586）Affymetrix Human Transcriptome Ar...
代码难弄的时候，有个笨办法。就是把探针列和gene symble列提取出来，在excel里用vlookup命令查找出哪些探针在我们的数据里，然后进行排序，就可以完成匹配了。还有就是有一些注释文件没有固定的gene symble列，但是可以看出来在哪一列，是不是用 / 来分割的。是的话也可以用excel根据/进行分裂，从而提取到gene symble信息
回答于 2020-09-10 22:23
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关于edgeR分析差异基因，请各位老师指导一下
一般来说不会的吧，在edgr处理TCGA数据的时候，中间会有一步得到校正后的表达矩阵，你把这个矩阵输出出来，用这个表达矩阵里的基因表达量试试看
回答于 2020-09-10 22:16
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有人做过TCGA和GEO数据的对应整合吗
您好，GEO数据库和TCGA数据联合分析大多是分别用这两个数据库来做同样的分析，用于去交集或者相互验证。样本信息来说，这两个数据库的样本来源是不同的，可能没办法进行样本的整合。
回答于 2020-09-10 22:12