使用GEO2R在线软件分析的数据是否是原始数据？

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4 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师 2017-11-27 16:30

不是原始的数据哦

杨博文 2017-11-28 23:09

不是哦，是GEO经过标准化以后的数据

strings 2017-12-05 11:14

GEO2R是提供源码的，可以看到读取的是GEO的matrix文件。即，标准化后数据。

王诗翔 - 研究生在读 2017-12-05 21:52

肯定不是原始数据，至于标准化方法需要参见具体的GSE研究。需要注意的是，GEO2R会将未Log的数据对数化，然后调用limma包处理。