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使用V6版本的TCGA,GBM-CLINICAL,不停断线重连
上面老师说简易下载工具不更新了，建议使用SangerBox。跟之前的工具盒使用方法类似，下载页见https://www.shengxin.ren/article/222
回答于 2018-06-21 20:42
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校验错误，无法连接生信人服务器
不影响使用，忽略即可。另外，有新的工具整合软件SangerBox。见https://www.shengxin.ren/article/222
回答于 2018-06-21 20:37
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还是没找到生存分析，这是我利用网上的现成数据进去的，没找到。
中间我选择数据的时候选的是TCGA，Provisional（见圈处），不知道跟这个有没有关系。 图上传不了。。。，那就看加粗字体 吧
回答于 2018-06-19 08:43
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TCGA基因表达（HTSeq-FPKM）的样本名称和临床资料（Clinical mer...
临床数据都是病人（患者）的随访数据，表达数据里含有对照样本。利用Excel中的数据菜单下的分列工具，可以对表达数据中的样本编号分列后，获得和临床信息中对应的编码；这是把编码对应的办法；另外，就是如果你做生存分析，批量生存分析，可以直接使用工具盒中的小工具，不需要进行编码，会自动匹配。具体可以参考https://w...
回答于 2018-06-15 09:20
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DEcenter差异分析的数据是否进行标准化？
你需要打开看一下下载后的数据，下载的数据是矩阵数据，不是作者上传的原始数据，一般是标准化的数据。打开看，如果都是10多或者10以内的数据集，就是标准化的；如果数据大小差别特别大，有十几，有成百上千的，就是没有标准化的，需要处理。
回答于 2018-06-05 17:02
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GEO芯片转换器
最重要的是数据和结果真实，数据怎么下载的可以参考其他文章，GEO数据是公共数据库。应该没人会追究这样的问题，况且GEO上面也可以直接下载。至于分析，主要是描述分析方法。个人拙见，仅供参考。
回答于 2018-05-03 10:30