disciplinant 的回答

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您好，有关问题请教。在结肠癌mRNA数据中，样本ID有的是TCGA-A6-... 已采纳

个人认为是“TCGA-A6-2674-01”的重复样本，请高手指教。

回答于 2018-04-21 10:45

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作图一般是需要自己加标注的，用这个工具通过调整参数让图更好看（颜值）。然后坐标后期自己再添加。

回答于 2018-04-21 10:42

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你应该在那个帖子下面跟帖啊

回答于 2018-04-10 15:24

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基本上都是取过对数的矩阵，你需要打开数据看一下，一般如果都是十几左右或以下就是已经取过对数的，如果是差异很大，有很小的（几十），又有特别大的（几百、几千）。就是没有取对数的。一般是Rawdata是原始数据。但是由于上传者的原因，需要打开数据看一下。

回答于 2018-04-04 10:38

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工具盒里有很多工具和小软件，你可以把里面的R也下载安装了应该就解决了

回答于 2018-03-26 08:35

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关闭也没事，下次启动会自动匹配下载过的，继续下载未完成的。

回答于 2018-03-25 08:22

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这个问题真的有点大，多看看文献，会知道一般的肿瘤研究的套路；比如差异基因（miRNA）分析，靶基因预测，GO和KEGG分析等等

回答于 2018-03-15 22:04

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我还是觉得你那个"current background: Pan troglogytes"不对，物种背景（current background）当前物种背景不是人类（homo sapiens）。当然，其他问题也可能啊，像祝神说的那种情况。

回答于 2018-03-12 19:55

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我只能回答一部分，GEO数据的差异看你是怎么来的，如果是通过GEO2R，save all results，然后下载下来的数据，一般是取过log的，在线分析会自动选择取log。至于DECenter的应该是可以选择的吧。没有具体操作呢。主要是下载数据用了。

回答于 2018-03-02 11:05

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是的，GEO中的数据不像TCGA那么完整规范；毕竟不是一个级别的。GEO都是个人或课题组做的芯片或测序数据，临床信息有的有，有的就没有，不全太常见了。就是下载很多也不见得会得到多少信息。

回答于 2018-01-12 16:15