先来回答第一个问题:你输入1000多个lncRNA结果只有400多个是因为数据原因导致,简单说是过滤掉的这些lncRNA数据差异特别大,没有办法进行生存分析;过滤条件样本中第25%的lncRNA表达量与第%50的表达量相同就会直接去掉;KM曲线样本的数量跟作图时候的方式有关,这里面你选择的是分位数,也就是分别取表达量最高的最低的前2...
回答于 2018-06-25 14:28
你这个用sangerbox里面的ID转化工具运行下,里面可以选择提取数据类型
回答于 2018-06-25 14:08
https://www.shengxin.ren/article/364按照这个配置一下,看看有没有帮助
回答于 2018-06-22 13:42
TCGA上面的可以用sangerbox里面的下载工具,检索到相应癌种,检索甲基化数据看下有没有450K的,下载好后点击合并即可;如果是GEO推荐使用IDM下载软件,支持断点续传。
回答于 2018-06-22 13:42