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510 个回答

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请问有dbGAP账号吗?需要一些数据 谢谢

这个这个还真的没有,问下其他人

回答于 2018-06-25 15:20

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您好,请问您是怎么解决mVISTA注释文件的问题的?可否指教一下?

没有搞过呀,你那个解决了嘛?分享下呀

回答于 2018-06-25 15:19

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GSEA运行出错,如图。

你这个是要做单个基因的GSEA还是所有基因的,如果所有基因需要给一个分组文件

回答于 2018-06-25 15:18

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想在虚拟机CENTOS7 上安装 GATK4.0 搞不定, 解压也不行

没有弄过呀,有什么报错吗?

回答于 2018-06-25 15:17

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我筛选出1000多个差异表达的lncRNA,做了批量生存分析之后,结果...

先来回答第一个问题:你输入1000多个lncRNA结果只有400多个是因为数据原因导致,简单说是过滤掉的这些lncRNA数据差异特别大,没有办法进行生存分析;过滤条件样本中第25%的lncRNA表达量与第%50的表达量相同就会直接去掉;KM曲线样本的数量跟作图时候的方式有关,这里面你选择的是分位数,也就是分别取表达量最高的最低的前2...

回答于 2018-06-25 14:28

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祝老师您好,使用 TCGA简易下载工具的 ENSG_ID转换功能自动成Mer...

你这个用sangerbox里面的ID转化工具运行下,里面可以选择提取数据类型

回答于 2018-06-25 14:08

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使用GSEA简易小工具分析GDSC的数据 表达谱数据未输入进小工具

数据保存时候用制表符分隔开

回答于 2018-06-22 17:47

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sangerbox安装后启动DEcenter工具失败

https://www.shengxin.ren/article/364按照这个配置一下,看看有没有帮助

回答于 2018-06-22 13:42

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450芯片怎么下载

TCGA上面的可以用sangerbox里面的下载工具,检索到相应癌种,检索甲基化数据看下有没有450K的,下载好后点击合并即可;如果是GEO推荐使用IDM下载软件,支持断点续传。

回答于 2018-06-22 13:42

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按照教程多个GEO数据集差异分析结果进行综合,RRA工具报错

这个你去看下输入的这几套基因集里面有共同出现的基因么,共同差异上调或下调。

回答于 2018-06-22 09:40