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510 个回答

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SangerBox便捷ID 转换器怎么使用呢

https://shengxin.ren/article/383 看看这个教程喽

回答于 2019-07-08 13:17

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TCGA简易下载工具,所有文件都下全了,合并不了文件是为什么

换个存放目录,或者检查下数据有没有下完整

回答于 2019-07-08 13:16

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GEO多芯片联合分析方法

这个就要看你分析数据样本量以及分析结果,可以每套数据单独做差异分析,然后通过robust rank aggregation(RRA)对差异分析结果合并,如果结果不理性,可以尝试所有样本合并到一起分析。

回答于 2019-07-08 13:15

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TCGA下载临床数据后合并数据后怎么转换到Excel表格

你可以用工具盒中的TCGA下载工具下载然后合并

回答于 2019-07-08 13:06

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运行sangerbox的DECenter时报错

这个问题是由于工具盒存放路径异常导致,不要有中文字符或其他特殊字符

回答于 2019-07-08 13:06

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分析GEO数据库GSE117830中lncRNA,但是分析出来ID没有见过,ASHG1...

这个是平台的探针ID吧,找对应的背景文件中应该有探针ID对应的ENSG或Gene symbol,如果没有可以,这个有探针序列可以考虑重注释,教程如下https://shengxin.ren/article/439

回答于 2019-07-05 10:01

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Firehose服务器:gdac.broadinstitute.org打不开

换个网络试试,或者换个下载方法

回答于 2019-07-01 13:46

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现在的桑格盒子下载TCGA临床信息后,如何合并为矩阵文件?

TCGA工具界面有一个合并文件,点击那个就可以

回答于 2019-07-01 13:46

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对编码基因的表达矩阵(数据格式:FPKM)进行WGCNA,为什么灰色模...

灰色模块里面的基因是没有聚到一起,这个可以降低模块中最小基因个数

回答于 2019-07-01 13:44

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请问在TCGA数据库中的RNA-seq中下载的mRNA基因表达谱数据是芯片...

使用工具盒现在的数据都是测序数据

回答于 2019-07-01 13:43