https://shengxin.ren/article/383 看看这个教程喽
回答于 2019-07-08 13:17
换个存放目录,或者检查下数据有没有下完整
回答于 2019-07-08 13:16
这个就要看你分析数据样本量以及分析结果,可以每套数据单独做差异分析,然后通过robust rank aggregation(RRA)对差异分析结果合并,如果结果不理性,可以尝试所有样本合并到一起分析。
回答于 2019-07-08 13:15
你可以用工具盒中的TCGA下载工具下载然后合并
回答于 2019-07-08 13:06
这个问题是由于工具盒存放路径异常导致,不要有中文字符或其他特殊字符
这个是平台的探针ID吧,找对应的背景文件中应该有探针ID对应的ENSG或Gene symbol,如果没有可以,这个有探针序列可以考虑重注释,教程如下https://shengxin.ren/article/439
回答于 2019-07-05 10:01
换个网络试试,或者换个下载方法
回答于 2019-07-01 13:46
TCGA工具界面有一个合并文件,点击那个就可以
灰色模块里面的基因是没有聚到一起,这个可以降低模块中最小基因个数
回答于 2019-07-01 13:44
使用工具盒现在的数据都是测序数据
回答于 2019-07-01 13:43